Strukturen hos agatsten är typiskt bandad, med omväxlande lager av olika färger och texturer. Banden kan vara raka, vågiga eller till och med spiralformade. Färgen på banden bestäms av de mineraler som finns i berget. Vanliga färger inkluderar rött, orange, gult, brunt och grönt. Agat kan också vara genomskinligt eller ogenomskinligt. Agats hårdhet är 6,5 till 7 på Mohs-skalan, vilket gör den till en relativt hållbar sten.