Ett fylogenetiskt träd är en grafisk representation av evolutionära relationer som visar hur organismer kan ha divergerat från en gemensam förfader. Tidigare gjordes detta genom jämförelse av anatomi och fysiologi hos levande organismer och fossiler, men nu används genetisk information från DNA-nukleotidsekvenser vanligen. Organismer med få likheter kan hittas på ett filogenetiskt träds separata "grenar" och de med specifika gemensamheter skulle vara placerade på "kvistar" av samma gren. Ett fylogenetiskt träd är en metod för att förstå arter och evolutionära förändringar i organismer.

Välj en modellorganisme för jämförelse av förhållanden. Detta kan göras med en art, ras eller nukleotidsekvens som representerar en organism. Ett exempel på organism kan vara en ko. Resten av trädet skulle visa hur nära en relation en ko är med andra organismer baserade på genetiska egenskaper.

Välj en outgroup. En utgrupp är en mindre närstående organism eller väldigt annorlunda nukleotidsekvens. Om modellorganismen är en ko, skulle en möjlig utgrupp vara en fisk. Ju mer olika två organismer är, desto längre ner på det fylogenetiska trädet kommer deras divergerande grenpunkt att vara. Tiden är representerad med det äldsta datumet längst ner i diagrammet och dagens dag står högst upp i diagrammet. Placeringen av grenarna visar ungefär när det tidigare var ett evolutionärt drag som möjligen ändrade en förfäderlig organism till olika arter.

Bestäm en uppsättning egenskaper som ska användas för jämförelse. Exempel är "har fyra ben", "chews cud", "ger levande födelse" eller "växer hår". Nukleotidsekvenser är bara alfabetiska representationer av DNA som bestämmer egenskaper, så ett annat alternativ skulle vara: "innehåller sekvensen ATGGACACGGA."

Dela organismer utifrån egenskaperna. När en organism inte innehåller den önskade egenskapen, görs en gren i det fylogenetiska trädet. För karaktäristiska "har fyra ben", kor, får och hjort skulle alla vara på en gren, medan fisken skulle vara på en separat gren. Klistra in en kos bild eller sekvens i det övre hörnet av affischtavlan och fisken i det motsatta hörnet och dra två linjer från dem till pappersbunten i en skärande V-form.

Fortsätt separera modellorganismer eller nukleotidsekvenser tills varje exempel har en enda separation från grenen till en kvist. Den karakteristiska "har ull" skulle separera får från hjort och kor på en enda gren. Placera fårets bild nära bilden av fisken och dra en linje som förbinder i en V-form ner till koens gren. Att använda den karakteristiska "har fluffiga svansen" skulle avgränsa ko från hjort. Klistra upp bilden av hjortan mellan koen och fåren och dra en annan linje i en V-form som skär över fisk- och fårlinjen. När varje art har en enda gren har det fylogenetiska trädet fullföljts.

Tips

Välj en ändlig uppsättning organismer eller sekvenser. Välj egenskaper eller sekvenser som delar organismerna i separata grupper. Har flera karakteristiska stöd för att visa organismerelationer.

Varning

Fylogenetisk placering kan diskuteras baserat på många egenskaper, och mycket stöd krävs för placeringstillfällen. Matematiska ekvationer kan vara nödvändiga för att visa den statistiska sannolikheten för evolutionära förändringar. Sannolikheten för divergensen på den genetiska nivån lämnar utrymme för eventuella felaktigheter i fylogenetiska träd.