Däggdjur
Enligt Southeastern Association of Fish and Wildlife Agency är den nordamerikanska flodutternen eller Lutra canadensis ett av de vanligaste däggdjuren i Louisiana. Denna art förekommer i de flesta våtmarksområden i staten, inklusive Atchafalaya River Basin. När de är fullt mogna är dessa flodkultar tre till fyra meter långa.
Louisiana-svarta björnen, eller Ursus americanus luteolus, är en underart av svarta björnen och finns i träskområden i hela södra Louisiana, inklusive Atchafalaya River Basin. En gång en riklig art har Louisianas svartbjörns befolkning minskat på grund av överjakt och destruktion av livsmiljöer. Den här björnen anses vara hotad av den amerikanska regeringen.
Träd
En av de vanligaste träd i Atchafalaya River Basin är den skalliga cypressen eller Taxodium distichum. Dessa barrträd förlorar inte sitt löv på vintern. De bor i eller nära vattnet. Efter fullmognad når skalliga cypresser höjder på cirka 130 fot. De flesta av dessa träd finns i den centrala regionen av Atchafalaya River Basin.
Vatten tupelo, eller Nyssa aquatica, finns i träskiga områden i hela Atchafalaya River Basin. Liknande den skalliga cypressen, är rötterna på detta träd ofta nedsänkt i vatten. Detta träd producerar grönblommor i månaderna mars och april. Vatten tupelos används ofta i träindustrin.
Fåglar
Roseate spoonbills, eller Platalea ajaja, liknar flamingor på grund av sina rosa färgade fjädrar. Dock har denna art ett grönt huvud. Det har också en spatelformad räkning som den använder för att hitta mat. Liksom flamingo kommer färgen av dess fjädrar från keratinet som finns i räkor, vilket är en del av spoonbillens diet.
Finns vanligtvis i hela södra Louisiana, stora äpplar eller Casmerodius albus är vita fjäderfåglar som finns i Atchafalaya River Basin. På 1800-talet jagades dessa fåglar för sina plumes och blev nästan utrotade. Stora örnar kommer inte att lämna bassängen om inte en vinter är onormalt kall.
Reptiler
Den amerikanska alligatorn, eller Alligator mississippiensis, är infödd i Atchafalaya River Basin, enligt History Channel. Denna reptiliska art är ca 10-15 fot lång när den är mogen. National Geographic staterna amerikanska alligatorn arter kan vara över 150 miljoner år gammal, vilket gör den till en av jordens äldsta djurarter.
National Wildlife Federation anger bomullsmonor eller Agkistrodon piscivorus, finns inom Atchafalayas gränser River Basin. När de är vuxna, kan cottonmouths nå längder på tre till fyra fot. Cottonmouths är giftiga. Denna typ av orm har värmeavkännande receptorer mellan näsborrarna och ögonen.