Förutom att lagra vattenresurser har ASR-tekniker den extra fördelen att de förbättrar vattenkvaliteten genom olika reaktioner i marken. De organiska föroreningarna i det laddade vattnet bryts ned genom interaktionen mellan mikroorganismer i akvifärjorden och järnoxidmineralerna, och i allmänhet omvandlas järnoxidmineralerna gradvis och den effektiva ytan minskar, vilket orsakar den naturliga försvagningen av organiska föroreningar att sluta.