Interaktionen mellan CRABS CLAW (CRC) och TORNADO2 (TRN2) gener spelar en avgörande roll för att reglera växtutveckling, särskilt vid bildning och underhåll av meristemer, som är de regioner där nya växtceller produceras. CRC kodar för ett protein som fungerar som en transkriptionsaktivator, medan TRN2 kodar för ett protein som fungerar som en transkriptionsrepressor.

Så här undertrycker CRC TRN2 i växtutveckling:

1. Direktbindning:CRC-protein binder direkt till specifika DNA-sekvenser kända som CRC-bindningsställen (CBS) belägna i promotorregionen av TRN2-genen. Denna bindning förhindrar transkriptionsfaktorerna från att komma åt promotorn och initiera TRN2-genexpression.

2. Konkurrens om bindningsställen:CRC- och TRN2-proteiner konkurrerar om bindning till samma CBS. När CRC binder till dessa platser konkurrerar det ut TRN2, vilket förhindrar TRN2 från att binda och aktiverar sitt eget genuttryck.

3. Sekvestrering av transkriptionsfaktorer:CRC-protein kan också fysiskt interagera med och sekvestrera transkriptionsfaktorer som krävs för TRN2-genuttryck. Genom att förhindra dessa transkriptionsfaktorer från att nå TRN2-promotorn, undertrycker CRC indirekt TRN2-uttryck.

4. Histonmodifieringar:CRC kan rekrytera kromatinmodifierande enzymer till TRN2-promotorregionen. Dessa enzymer modifierar kromatinstrukturen, vilket gör den mindre tillgänglig för transkriptionsfaktorer och RNA-polymeras, och därigenom undertrycker TRN2-genuttrycket.

5. miRNA-medierad reglering:CRC kan reglera TRN2-uttryck indirekt genom att modulera nivåerna av mikroRNA (miRNA) som riktar sig till TRN2-transkriptet. CRC kan inducera uttrycket av miRNA som binder till TRN2-mRNA:t och riktar sig mot det för nedbrytning, och därigenom minska TRN2-proteinnivåerna.

Genom att använda dessa mekanismer undertrycker CRC effektivt TRN2-uttryck i växtutveckling, vilket säkerställer korrekt meristemfunktion, organbildning och övergripande växttillväxt och utveckling.