Den mänskliga aktiviteten som har den mest negativa effekten på stabiliteten i en sjömiljö är övergödning, vilket är anrikningen av en vattenförekomst med näringsämnen, särskilt kväve och fosfor. Dessa näringsämnen kan komma från en mängd olika källor, inklusive avrinning från jordbruket, avloppsvatten och industriellt avloppsvatten. Övergödning kan leda till algblomning, vilket kan blockera solljus från att nå undervattensväxter och minska mängden syre i vattnet. Detta kan ha en negativ inverkan på hela sjöns ekosystem, inklusive fiskar, groddjur och ryggradslösa djur. Dessutom kan övergödning också leda till ansamling av giftiga kemikalier i vattnet, vilket kan utgöra en hälsorisk för människor och vilda djur.