* genetisk arv: Darwin förstod inte arvsmekanismen. Han visste att drag överfördes från föräldrar till avkommor, men han visste inte hur. Detta förklarades senare av Gregor Mendels arbete med genetik.
* DNA som bärare av genetisk information: Darwin var inte medveten om förekomsten av DNA. Upptäckten av DNA som molekylen som var ansvarig för att bära genetisk information kom mycket senare.
* mutationer som variationskälla: Darwin insåg att variationer fanns inom populationer, men han förstod inte hur dessa variationer uppstod. Mutationer, som är förändringar i DNA -sekvensen, förstås nu vara den primära källan till nya variationer.
* Punkterad jämvikt: Denna teori, föreslagen av Stephen Jay Gould och Niles Eldredge, antyder att evolutionen sker i skurar av snabb förändring ispedd långa perioder med stabilitet. Darwins teori betonade å andra sidan gradvis förändring över tid.
Det är viktigt att komma ihåg att Darwins teori var baserad på den kunskap som finns tillgänglig under hans tid. När vetenskapen har utvecklats har vår förståelse av evolutionen blivit mer sofistikerad, införlivat nya principer och utvidgat Darwins ursprungliga idéer.
