DNA i en nanokanal. Kredit:SISSA
Ett enkelt och effektivt sätt att reda ut den ofta trassliga massan av DNA är att 'tråda' tråden i en nanokanal. En studie utförd med deltagande av International School for Advanced Studies i Trieste använde simuleringar för att mäta de egenskaper som denna kanal bör ha för att uppnå maximal effektivitet.
Med den utbredda användningen av metoder för DNA -analys och manipulation, det är verkligen användbart att hitta ett sätt att riva upp och slappna av delarna av denna molekyl som tenderar att bilda trassel spontant. Ett sätt är att använda kanaler, eller snarare nanokanaler, som Cristian Micheletti, SISSA -forskare, och Enzo Orlandini, från Padua University, gjorde i en studie som just publicerats i tidskriften Makrobokstäver .
Tanken är att tvinga in DNA:t i kanalen för att slappna av det helt. "Men inte vilken kanal som helst kommer att göra, "förklarar Micheletti." Beroende på nanokanalens diameter, strängändarna kan ordna sig i krokliknande strukturer som kommer att bilda en knut ".
"I vår studie använde vi simuleringstekniker för att karakterisera de mekanismer som leder till knutbildning som en funktion av kanalens diameter", Micheletti fortsätter.