Rice University forskare har släppt de första resultaten av omfattande vattenprovtagning i Houston efter den episka översvämningen orsakad av orkanen Harvey. De fann utbredd förorening av E coli , troligtvis resultatet av överflöd från översvämmade avloppsreningsverk.

Den mikrobiella undersökningen visade höga nivåer av E coli , en avföringsindikatororganism, fångade i hem som fortfarande innehöll stillastående vatten veckor efter stormen, liksom höga nivåer av nyckelgener som indikerar antibiotikaresistens.

Studien som leds av Rice miljöingenjör Lauren Stadler förekommer i American Chemical Society journal Environmental Science &Technology Letters . Ett par National Science Foundation RAPID -bidrag hjälpte laget att samla in och analysera prover.

Ris miljöingenjörer Stadler, Qilin Li och Pedro Alvarez och deras elever stod i frontlinjen, även innan Harvey avtog, att ta prover från översvämningar nära de överfulla Brays och Buffalo bayous, i offentliga utrymmen och i och utanför bostadshus för att jämföra deras mikrobiella innehåll. Prover av stillastående vatten togs från hem som hade stängts av i mer än en vecka, medan andra togs från hem som hade översvämningsvatten som flödade genom dem.

Tidiga prover från varje plats bar förhöjda nivåer av E coli . Men mest slående var det faktum att vattenprov och senare, sediment visade rikliga halter av två indikatorgener, sul1 och intI1, som markerar förekomsten av antibiotikaresistenta bakterier, även veckor efter översvämningen. Särskilt, prover från översvämningar i slutna hem visade att koncentrationerna av sul1 var 250 gånger större och intI1 60 gånger större än i bayou -prover.

"Sul1 är en gen som ger resistens mot sulfonamidantibiotika, sa Stadler, en biträdande professor i civil- och miljöteknik. "IntI1 är inte en antibiotikaresistent gen, men en integron-integrasgen som kodar för ett system för genavskiljning och spridning och kan leda till spridning av antibiotikaresistenta gener bland bakterier. Många antibiotikaresistenta gener är på eller associerade med mobila genetiska element som plasmider som kan delas mellan bakterier.

"Vi riktar intI1 eftersom integroner ofta finns på mobila genetiska element och indikerar den genetiska rörligheten hos en gen, "sa hon." De är också ofta förknippade med antibiotikaresistens, och överflödet av dessa gener ger oss en känsla av potentialen för horisontell genöverföring bland bakterier.

"Det spelar roll för medan vi ser dessa gener i miljöbakterier hela tiden, vi oroar oss verkligen när patogena bakterier skaffar resistenta gener från miljöbakterier, "Stadler." Det är då det är ett problem-när det finns en antibiotikaresistent patogen. Om du utsätts för en av dem, det är då du ser infektioner som är riktigt svåra att behandla. "

Den omedelbara hämtningen från studien, Hon sa, är att människor ska vara extra försiktiga för att undvika direktkontakt med stillastående översvämningar, särskilt i översvämmade hem med nischer för att patogener ska växa.

"Bär skyddsutrustning, och gå inte in alls om du är immunkompromitterad eller har öppna sår, " Hon sa.

Stadlers forskargrupp använder erfarenheterna från Harvey för att utveckla verktyg för att mäta horisontell genöverföring när den sker i miljön.