H. floresiensis tros ha utvecklats från en tidig hominid som kom till Flores för cirka 840 000 år sedan. Man tror att dessa tidiga hominider var strandsatta på ön och med tiden utvecklats till en mindre, mer kompakt form. Denna minskning i storlek tros vara ett resultat av ö-dvärgväxt, ett fenomen som uppstår när djur som lever på öar blir mindre än sina släktingar på fastlandet.
Ödvärgväxt tros uppstå av ett antal anledningar, inklusive begränsade resurser, konkurrens från andra arter och brist på rovdjur. När det gäller H. floresiensis tror man att öns begränsade resurser och konkurrensen från andra djur, som jätteråttor och komodo-drakar, kan ha varit de främsta faktorerna som lett till dess ringa storlek.
H. floresiensis är en av de mest intressanta och gåtfulla hominidarter som någonsin har upptäckts. Dess ringa storlek, unika egenskaper och det faktum att den levde till relativt nyligen gör den till en viktig del av människans evolutionära historia.