Junos huvudsakliga vetenskapsmål är att undersöka Jupiters inre struktur och dynamik, inklusive dess vattenmängd och fördelning, egenskaperna hos dess atmosfär och de magnetiska fält som genereras av dess snabba rotation. För att uppnå dessa mål är Juno utrustad med en svit av vetenskapliga instrument, inklusive en magnetometer, en mikrovågsradiometer, en bildapparat för synligt ljus och en svit av spektrometrar.
Några specifika mål för Junos uppdrag inkluderar:
Bestämma Jupiters inre struktur och sammansättning
Studerar Jupiters atmosfär, inklusive dess sammansättning, cirkulationsmönster och molnstruktur
Undersöker genereringen av Jupiters kraftfulla magnetfält
Utforska Jupiters polära magnetosfär och norrsken
Att observera Jupiters månar, inklusive de stora månarna Ganymedes, Europa och Callisto
Genom sina observationer och mätningar strävar Juno efter att ge en bättre förståelse av Jupiters bildning och evolution, och dess roll i solsystemets bredare sammanhang.