Det finns dock en del debatt om detta:
* Brist på definitiva bevis: Det finns ingen överlevande dokumentation av Janssens mikroskop, och informationen om dess uppfinning kommer från sekundära källor.
* Andra utmanare: Vissa historiker föreslår att Cornelis Drebbel, en holländsk uppfinnare, kan ha utvecklat ett liknande mikroskop oberoende ungefär samtidigt.
Även om Janssen ofta krediteras uppfinningen av föreningsmikroskopet, är det viktigt att komma ihåg att det exakta ursprunget och tidslinjen förblir något osäker.