* karakterisera Neptunes atmosfär: Mät atmosfärisk sammansättning, temperatur, tryck och vindhastigheter.
* Studera Neptuns ringar: Bestäm deras sammansättning, struktur och ursprung.
* Observera Neptunes månar: Upptäck nya månar, kartlägga sina ytor och analysera deras geologiska drag.
* Undersök Neptunes magnetfält: Bestäm dess styrka, form och orientering.
* Sök efter ytterligare planeter utöver Neptune: Även om detta inte var ett primärt mål, möjliggjorde Voyager 2:s bana en sökning efter potentiella ytterligare planeter i det yttre solsystemet.
Utöver dessa specifika mål gav Voyager 2:s Flyby of Neptune värdefull information som hjälpte oss att förstå bildningen och utvecklingen av det yttre solsystemet, gigantiska planeter och dynamiken i planetsystem i allmänhet.