I ett steg mot att överbrygga klyftan mellan svamptaxonomi och molekylär ekologi, forskare från flera institutioner inklusive Los Alamos National Laboratory har karakteriserat ett prov av "mystiska" svampar som samlats in i North Carolina och hittat sitt hem i livets svampträd.

"Arbetsberäkningar säger oss att det borde finnas mer än 5 miljoner arter av svampar, sa Cheryl Kuske, en Los Alamos-forskare på projektet. "Vi har egentligen bara identifierat och fullständigt beskrivit 100, 000 av dem, fastän, och nya DNA-sekvenseringsmöjligheter visar oss att många, många exemplar i forskningssamlingar är okarakteriserade. Att lösa detta speciella mysterium visar det potentiella värdet av att använda miljösekvensering för att vägleda taxonomiska och ekologiska upptäckter."

Svampprovet var intressant delvis eftersom det representerade en viktig komponent av den observerade svamppopulationen i en tallskog och det svarade positivt på förhöjda CO2- och kväveförändringsbehandlingar som efterliknar framtida miljöförhållanden - men provets exakta placering i den taxonomiska ordningen var okänd. Provet fick så småningom ett nytt namn, Bifiguratus adelaidae , som nyligen rapporterats i tidningen Mycologia .

Varför var detta svårt? I tider när en enkel kindpinne som skickas med en check kan producera en mänsklig DNA-rapport som listar tusentals förfäder, en providentifiering verkar vara en enkel uppgift. Men som en ledare i tidskriften påpekade, detta prov representerade en av många "mörk materia svampar" som befolkar okända regioner av livets svampträd. Vi kan upptäcka deras DNA i miljöprover, men deras kultur har varit svårfångad.

Som noterats i tidskriftens ledare, "Denna placering är särskilt spännande på grund av den ökade förståelsen för mykorrhizarollen (förmågan att bilda symbiotisk, närings-överföringsförhållanden) för denna del av fylogenin och det faktum att mycket lite är känt om arternas mångfald och utbredning i denna del av trädet. Bifiguratus adelaidae kan ha en symbiotisk funktion i rötterna, har upptäckts i orkidé- och kastanjerötter, men det är också väldokumenterat i jordar från nordliga tempererade zoner."

Intressant, det insamlade provet hade odlats framgångsrikt i laboratoriet först när det fick växa i sällskap med en bakterieart, Metylobacterium , att antibiotika inte kunde döda. Normalt skulle svampprovet ha rensats från sådana föroreningar, men den här stod emot deras försök. Författarna hävdar att de symbiotiska eller kommensala mikrobernas närvaro kan vara en del av odlingsframgången. Att förstå komplexa mikrobiella och svampsamhällen går framåt, Kuske noterade, genom att låta organismer växa som definierade blandningar.

Los Alamos National Laboratory bedriver ett brett utbud av biologiska forskningsinsatser som en del av sitt nationella säkerhetsforskningsuppdrag, med sådan forskning som fylogenetisk analys för att bestämma säkra kontra farliga patogener och för att identifiera sjukdomsöverföringsvägar.

De Bifiguratus adelaidae namngavs för att hedra Adelaida Chaverri Polini. Dr Chaverri var en världserkänd tropisk biolog och förebild för kvinnor i Latinamerika inom vetenskap, teknologi, teknik, och matematik. Hennes viktigaste bidrag var i studien och bevarandet av tropiska bergsskogar och trädlösa alpina gräsmarker (páramos). Som biolog, hon insåg vikten av mykorrhizasvampar och bidrog till beskrivningen av en svamp i Acaulosporaceae , en svamp i samma filum som arten som beskrivs i denna artikel. Hon stödde skapandet av Costa Ricas National Park Service, utgör grunden för omfattande bevarande av biologisk mångfald. Under 2013, hon ingick i Galería de la Mujer, en av de högsta utmärkelser som ges till costaricanska kvinnor för deras engagemang för att försvara och förbättra kvinnors mänskliga rättigheter.