Forskare vid Umeå och Stockholms universitet i Sverige och Johns Hopkins University School of Medicine i USA har publicerat en ny studie i tidskriften Molekylär cell . De visar hur proteinet CBP påverkar uttrycket av gener genom dess interaktion med det basala maskineriet som läser instruktionerna i vårt DNA.

DNA innehåller instruktioner för hur cellen ska sätta ihop funktionella proteiner. Innan DNA -koden kan översättas till en rad aminosyror som sedan viks till ett funktionellt protein, en mellanliggande RNA -molekyl produceras. Denna RNA -molekyl är en kopia av genen som innehåller instruktionerna för ett specifikt protein. Olika proteiner behövs i olika mängder, och mycket av regleringen av proteinnivåer sker genom att kontrollera hur många RNA -kopior som produceras från varje gen.

RNA -polymeras är enzymet som producerar RNA -kopian, och mängden RNA som produceras från varje gen beror på två huvudsteg:rekrytering av RNA -polymeras till början av en gen; och frigörandet av enzymet från startpositionen så att det kan påbörja kopieringsprocessen. Per Stenbergs team vid Umeå universitet och kollegor studerade hur proteinet CBP påverkar dessa två steg.

"Vi, liksom andra, har tidigare visat att proteinet CBP är involverat i flera olika processer i cellen. Men det har inte tidigare varit känt att CBP är direkt involverad i rekryteringen av RNA -polymeras till generna. Vi kan också visa att det beror på en interaktion med en tidigare känd faktor, TFIIB, säger Per Stenberg, forskare vid institutionen för molekylärbiologi vid Umeå universitet, och vid Försvarsforskningsverket (FOI).

När CBP -funktionen experimentellt störs, gener har svårt att rekrytera RNA -polymeras, vilket leder till ett lägre antal proteiner som ska produceras. Forskarna upptäckte att CBP också påverkar effektiviteten av frisättningen av RNA -polymeras från genstarten så att det kan initiera kopieringsprocessen.

"Vi blev verkligen förvånade när vi upptäckte att utan CBP, RNA -polymeraset inte kan positionera sig korrekt vid genstarten, och att det hade svårare att starta kopieringsprocessen, säger Per Stenberg.

De nya insikterna har publicerats i tidningen Molekylär cell , och förbättra förståelsen för genreglering, förklarar varför proteinet CBP ofta påverkas i prostata, bröst- och lungcancer.