Oreglerade R-slingor kan orsaka avstannade replikationsgafflar och telomerinstabilitet. Men hur R-slingor känns igen och regleras är fortfarande inte väl förstått, särskilt vid telomerer.

I en ny studie använde forskare närhetsberoende biotinidentifieringsteknik (BioID) för att identifiera ILF3-interaktomen och upptäckte att ILF3 interagerar med flera DNA/RNA-helikaser, inklusive DHX9. Denna interaktion tyder på att ILF3 kan underlätta upplösningen av telomera R-loopar, och därigenom förhindra onormal homolog rekombination och bibehålla telomerhomeostas.

Verket, med titeln "ILF3 skyddar telomerer från avvikande homolog rekombination som en telomer R-loop-läsare", publicerades i Protein &Cell .

Viktiga resultat från studien inkluderar:

1. ILF3 uppvisar selektiv interaktion med telomera R-slingor och skyddar därigenom telomerer mot avvikande homolog rekombination.
2. ILF3-förlust av funktion höjer följaktligen TERRA-nivåerna, vilket utlöser ackumuleringen av R-slingor vid telomerer. Denna ackumulering inducerar DNA-skaderespons (DDR) och telomerdysfunktion, kännetecknad av förhöjda TIF, telomerbräcklighet och närvaron av extrakromosomala telomerfragment, vilket i sin tur kan aktivera ALT-vägen.
3. Dessutom avslöjade kartläggningen av ILF3-interaktomen interaktioner med olika DNA/RNA-helikaser, inklusive DHX9, med en betydande implikation att ILF3 potentiellt hjälper till att lösa telomera R-loopar genom sin interaktion med DHX9.
4. ILF3 fungerar potentiellt som en läsare för telomera R-slingor, vilket hjälper till att förhindra avvikande homolog rekombination och upprätthålla telomerhomeostas.

Dessa resultat stöder att ILF3 interagerar med telomera RNA:DNA-hybridstrukturer såsom R-loopar och främjar upplösningen eller hämmar överdriven ackumulering av R-loopar genom RNA-helikasen DHX9.

Denna forskning ger nya insikter om regleringen av telomera R-slingor och mekanismerna som upprätthåller telomerhomeostas, med implikationer för åldrandebiologin.

Mer information: Chuanle Wang et al, ILF3 skyddar telomerer från avvikande homolog rekombination som en telomer R-loop-läsare, Protein &Cell (2023). DOI:10.1093/procel/pwad054

Tillhandahålls av Frontiers Journals