Forskare har utvecklat en ny teknik för att kartlägga interaktionerna mellan RNA och kromatin i genomet. Denna teknik, som kallas ChIRP-nexus (Chromatin Isolation by RNA Purification följt av Nexus-analys), ger en heltäckande bild av hur RNA-molekyler interagerar med DNA och proteiner i kärnan.

Forskarna använde ChIRP-nexus för att studera interaktionerna mellan RNA och kromatin i mänskliga celler. De fann att RNA-molekyler interagerar med ett brett utbud av kromatinregioner, inklusive genpromotorer, förstärkare och ljuddämpare. Dessa interaktioner spelar en avgörande roll i genreglering, eftersom de kan kontrollera tillgängligheten av DNA till transkriptionsfaktorer och andra proteiner.

"Vår metod är en extremt känslig och mångsidig plattform för global analys av RNA-kromatininteraktioner", säger seniorförfattaren Dr. Chuan He vid University of Chicago. "Det kan identifiera RNA-bindande proteiner på ett genomomfattande och opartiskt sätt, och resultaten kan användas för att bättre förstå mekanismerna för genreglering och utveckla nya terapeutiska strategier för olika sjukdomar."

ChIRP-nexus är ett kraftfullt nytt verktyg som kommer att hjälpa forskare att bättre förstå hur RNA-molekyler interagerar med kromatin i genomet. Denna information kommer att vara väsentlig för att förstå genreglering och utveckla nya terapeutiska strategier för ett brett spektrum av sjukdomar.