Abstrakt:
Kungspingviner (Aptenodytes patagonicus) är ikoniska flyglösa fåglar som bor i de subantarktiska områdena i södra oceanen. Crozetöarna, en avlägsen skärgård i södra Indiska oceanen, är hem för en av de största häckande populationerna av kungspingviner. Den evolutionära historien och genetiska anpassningarna av kungspingviner på Crozetöarna är dock fortfarande dåligt förstådda. I denna studie genomförde vi en omfattande genomanalys av kungspingviner från Crozetöarna för att belysa deras evolutionära relationer, populationsstruktur och genetiska anpassningar.
Metoder:
Vi tog blodprover från 50 kungspingviner på Crozetöarna och extraherade genomiskt DNA. High-throughput-sekvensering utfördes för att erhålla helgenomdata för varje individ. Vi satte ihop genomet de novo och kommenterade de proteinkodande generna. Fylogenetiska analyser utfördes för att sluta sig till de evolutionära förhållandena mellan kungspingviner från Crozetöarna och andra populationer. Befolkningsgenetiska analyser utfördes för att bedöma den genetiska mångfalden och strukturen inom Crozetöarnas befolkning. Genomomfattande skanningar genomfördes för att identifiera signaturer av naturligt urval och potentiella adaptiva gener.
Resultat:
Vår fylogenetiska analys avslöjade att kungspingviner från Crozetöarna bildar en distinkt genetisk klädsel, vilket tyder på en lång evolutionär historia av isolering från andra populationer. Den genetiska populationsanalysen indikerade en relativt hög nivå av genetisk mångfald inom Crozetöarnas befolkning, vilket tyder på att populationen har varit stabil under en lång period. Genomomfattande skanningar identifierade flera regioner av genomet som visade signaturer för naturligt urval, inklusive gener involverade i lipidmetabolism, termoreglering och immunfunktion. Dessa fynd tyder på att kungspingviner på Crozetöarna har genomgått genetiska anpassningar för att klara av de unika miljöförhållandena i den subantarktiska regionen.
Slutsats:
Vår studie ger värdefulla insikter i den evolutionära historien och genetiska anpassningarna av kungspingviner på Crozetöarna. De genomiska data och analys som presenteras i denna studie kommer att bidra till bevarandet och förvaltningen av denna ikoniska sjöfågelart och hjälpa oss att bättre förstå de evolutionära processer som har format den biologiska mångfalden i den subantarktiska regionen.