- Obligatoriska anaerober:dessa organismer kan inte överleva i närvaro av syre och använder därför inte syre som en slutlig elektronacceptor i cellandning. Istället använder de alternativa elektronacceptorer som sulfat, nitrat eller fumarat. Exempel på obligatoriska anaerober inkluderar vissa bakterier och archaea.

- Fakultativa anaerober:dessa organismer kan växla mellan aerob andning (i närvaro av syre) och anaerob andning (i frånvaro av syre) beroende på tillgången på syre. När syre finns använder de aerob andning, men när syrehalten sjunker övergår de till anaerob andning. Exempel på fakultativa anaerober inkluderar jäst, vissa bakterier och vissa parasitmaskar.

- Aerotoleranta anaerober:dessa organismer växer normalt inte i närvaro av syre men kan överleva eller växa i dess närvaro. De använder dock inte syre som en terminal elektronacceptor vid andning; de använder alternativa vägar. Vissa aerotoleranta anaerober kan ha kvarvarande enzymer för andning, men dessa enzymer är inte aktiva under aeroba förhållanden. Exempel inkluderar vissa bakterier och svampar.

- Mikroaerofiler:dessa organismer kräver en låg koncentration av syre för tillväxt och kan inte tolerera de höga syrehalterna som finns i atmosfären. De har specialiserade enzymer och metabola vägar som fungerar bäst vid låga syrenivåer. Exempel inkluderar vissa bakterier och vissa arter av arkéer.

- Archaea:medan vissa archaea utför andning med hjälp av elektrontransportkedjor som liknar de i andra organismer, använder andra andra mekanismer för att generera ATP. Till exempel använder vissa arkéer alternativa elektronbärare, medan andra använder unika metaboliska vägar som metanogenes eller acetogenes.