1. Sekvensering:
* nästa generations sekvensering (NGS): Fragmentering av DNA i mindre bitar är viktigt för NGS -tekniker. Detta beror på att dessa tekniker endast kan sekvensera relativt korta fragment (vanligtvis 100-500 baspar). Fragmentering möjliggör effektiv sekvensering av hela genomet.
* sanger sekvensering: Även om det inte är så vanligt som NGS, kräver Sanger -sekvensering också ofta fragmenterat DNA. Detta beror på att sekvenseringsreaktionen fungerar bäst med mindre DNA -fragment.
2. Microarrays:
* Genombredda associeringsstudier (GWAS): Fragmentering av DNA möjliggör skapandet av enkelsträngade sonder som kan hybridiseras till mikroarrayer. Dessa mikroarrayer kan sedan användas för att identifiera genetiska variationer förknippade med sjukdomar eller andra drag.
3. Biblioteksförberedelser för sekvensering:
* Biblioteksförberedelser: Fragmentering är ett kritiskt steg i biblioteksförberedelserna för sekvensering. Det säkerställer att DNA är rätt storlek för sekvensering och möjliggör tillägg av nödvändiga adaptrar.
4. Begränsningsenzym matsmältning:
* genetisk kartläggning: Fragmentering av DNA med användning av restriktionsenzymer kan användas för att skapa en genetisk karta. Begränsningsenzymer skär DNA vid specifika sekvenser, vilket skapar unika fragment som kan användas för att identifiera platsen för gener på kromosomer.
5. Polymeraskedjereaktion (PCR):
* PCR -amplifiering: Även om PCR inte alltid kräver fragmentering, är ibland mål -DNA för lång för att förstärka effektivt. Fragmentering möjliggör mindre, mer hanterbara bitar som kan förstärkas mer effektivt.
6. Elektrofores:
* gelelektrofores: Fragmentering av DNA möjliggör separering baserat på storlek. Detta är användbart för att analysera DNA -prover och identifiera specifika fragment.
7. Andra applikationer:
* kloning: Fragmentering kan användas för att isolera specifika DNA -sekvenser för kloning.
* genredigering: Fragmentering används ibland i genredigeringstekniker för att införa specifika förändringar i genomet.
Sammanfattningsvis är fragmentering av DNA en vanlig teknik som används i många molekylära biologiska tillämpningar. Det möjliggör effektivare analys, sekvensering och manipulation av DNA, vilket leder till en bättre förståelse av genetisk information.
