* Reproduktiv isolering: Liksom många andra djur har olika fladdermusarter utvecklats distinkta parningsbeteenden, samtal och fysiska egenskaper. Dessa skillnader fungerar som hinder för blandning.
* genetiska skillnader: Även om två arter lyckas para sig är deras DNA ofta för annorlunda för att producera livskraftiga avkommor. De resulterande embryonen kanske inte utvecklas ordentligt, eller avkomman kan vara infertila.
* ekologisk specialisering: Batarter har ofta specialiserade dieter och livsmiljöer, vilket bidrar till deras reproduktiva isolering. Det betyder att de kanske inte ens stöter på varandra i naturen för att para.
Det har emellertid förekommit sällsynta fall av hybridisering, särskilt inom nära besläktade arter. Till exempel har vissa forskare dokumenterat fall av blandning mellan * Myotis lucifugus * (Little Brown Bat) och * myotis yumanensis * (Yuma myotis). Men dessa fall anses i allmänhet undantag snarare än regeln.
Kort sagt, även om det inte är omöjligt för fladdermöss av olika arter att blandas, är det mycket ovanligt och resulterar ofta i icke-livskraftiga avkommor.