Denna klassificering baserades på det faktum att båda grupperna är prokaryota, vilket innebär att de saknar en kärna och andra membranbundna organeller. Ytterligare forskning avslöjade emellertid signifikanta skillnader i deras cellstrukturer, biokemi och genetik, vilket ledde till separering av eubakterier (nu helt enkelt bakterier) och archaebacteria (nu helt enkelt archaea) i separata kungarike.
