1. Aminosyrasekvens (primärstruktur): Detta är den grundläggande byggstenen. Den specifika ordningen för aminosyror i en polypeptidkedja dikterar alla efterföljande strukturella nivåer. Varje aminosyra har unika egenskaper (storlek, laddning, hydrofobicitet) som påverkar interaktioner och vikning.
2. Vätebindning: En viktig interaktion mellan aminosyrasidokedjor och peptidryggraden. Dessa bindningar hjälper till att stabilisera sekundära strukturer som alfa-helices och beta-ark.
3. Hydrofoba interaktioner: Icke -polära aminosyror tenderar att klustera ihop i proteinets interiör, bort från den vattenhaltiga miljön. Detta driver vikning och skapar en hydrofob kärna.
4. Elektrostatiska interaktioner: Laddade aminosyror (joniska interaktioner) lockar eller avvisar varandra och påverkar proteinform och stabilitet.
5. Van der Waals Interaktioner: Svaga, korta räckvidd attraktioner mellan alla atomer i ett protein bidrar till total stabilitet.
6. Disulfidbindningar: Kovalenta bindningar mellan cysteinrester kan skapa starka kopplingar som stabiliserar proteinstrukturen, särskilt i extracellulära proteiner.
7. Interaktioner med lösningsmedel (vatten): Den omgivande miljön (t.ex. vatten, lipider) kan påverka proteinvikning och konformation genom att gynna interaktioner med vissa aminosyror.
8. Chaperones: Cellulära proteiner som hjälper till med korrekt proteinvikning, förhindrar aggregering och felfoldning.
9. Post-translationella modifieringar: Kemiska modifieringar efter översättning kan förändra proteinstruktur och funktion. Exempel inkluderar fosforylering, glykosylering och acetylering.
10. Temperatur och pH: Dessa faktorer kan störa den känsliga balansen mellan krafter som upprätthåller proteinstrukturen.
hierarkisk struktur:
* Primärstruktur: Den linjära sekvensen av aminosyror.
* Sekundär struktur: Lokala vikningsmönster, som alfa-helices och beta-ark, bildade genom vätebindning i peptidryggraden.
* tertiär struktur: Den övergripande tredimensionella formen av en enda polypeptidkedja, som härrör från interaktioner mellan sidokedjor.
* kvartärstruktur: Arrangemanget av flera polypeptidkedjor (underenheter) till ett funktionellt proteinkomplex.
Faktorer som påverkar proteinstrukturen är tätt sammanflätade och en förändring i en kan påverka hela proteins konformation och funktion. Detta intrikata samspel säkerställer att proteiner utför sina olika roller i levande organismer.
