1. fosfatgrupp: Detta är en negativt laddad grupp som ger nukleotider deras sura egenskaper. Det är också viktigt för energilagring och överföringsfunktioner för nukleotider.

2. sockergrupp: Detta är ett fem-kolsocker, antingen ribos (i RNA) eller deoxyribos (i DNA). Sockret ger nukleotidens ryggradstruktur och möjliggör fästning av basen.

3. kvävehaltig bas: Detta är en heterocyklisk ringstruktur som innehåller kväveatomer. Det finns fem huvudtyper av kvävebaser:adenin (A), guanin (G), cytosin (C), tymin (T) och uracil (U). Den specifika basen fäst vid sockret bestämmer nukleotidens identitet.

Dessa tre funktionella grupper är kopplade samman för att bilda en enda nukleotidmolekyl. Fosfatgruppen är fäst vid sockerens 5 'kol, den kvävehaltiga basen är fäst vid sockerens 1' kol, och hydroxylgruppen vid sockerens 3 'kol finns tillgängligt för bindning till fosfatgruppen i nästa nukleotid i en kedja.