Det finns emellertid några viktiga skillnader mellan prokaryot DNA och eukaryot DNA:

* Plats: I prokaryoter ligger DNA i en region som kallas nukleoid , som inte är innesluten av ett membran som kärnan i eukaryota celler.

* Struktur: Prokaryotiskt DNA är vanligtvis cirkulärt och enkelsträngade medan eukaryot DNA är linjärt och dubbelsträngat.

* Organisation: Prokaryot DNA är vanligtvis inte associerat med histoner , proteinerna som hjälper till att organisera eukaryota DNA.

Det är viktigt att notera att vissa prokaryoter har plasmider , som är små, cirkulära DNA -molekyler som finns oberoende av huvudkromosomen. Dessa plasmider bär ofta gener som ger bakterier fördelar, såsom antibiotikaresistens.