RNA -polymeraser är enzymer som är ansvariga för att transkribera DNA till RNA. Olika typer av RNA -polymeraser finns i eukaryoter och prokaryoter, var och en med dess specifika funktioner och promotorigenkänningssekvenser.
* RNA -polymeras (RNAP) :Det enda RNA -polymeraset i prokaryoter transkriberar alla typer av RNA (mRNA, tRNA, rRNA).
* Promotorstruktur:
* -10 element (pribnow box): Tataat -sekvens ligger cirka 10 baspar uppströms från transkriptionsstartplatsen.
* -35 element: TTGACA -sekvens belägen cirka 35 baspar uppströms från transkriptionsstartplatsen.
* uppströmselement: Vissa promotorer har ytterligare element längre uppströms, vilket påverkar transkriptionseffektiviteten.
* RNA -polymeras I (pol I): Ansvarig för att transkribera ribosomala RNA (rRNA) gener.
* Promotorstruktur:
* kärnpromotör: En region som innehåller ett kärnelement och ett uppströms kontrollelement (UCE).
* Core Element: En kort sekvens belägen cirka 40 bp uppströms om transkriptionsstartplatsen.
* uce: En region som ligger ungefär 100 bp uppströms om transkriptionsstartplatsen, som ofta innehåller en konserverad sekvens som kallas "uppströmselementet" (UE).
* RNA -polymeras II (pol II): Transkriberar proteinkodande gener (mRNA) och några små kärn-RNA (SNRNA) gener.
* Promotorstruktur:
* kärnpromotör: Innehåller vanligtvis följande element:
* tata Box: En konserverad sekvens belägen cirka 25-30 bp uppströms om transkriptionsstartplatsen.
* initiator (INR): En sekvens som ligger runt transkriptionsstartplatsen.
* nedströms promotorelement (DPE): Beläget nedströms om transkriptionsstartplatsen.
* bre (tfiib igenkänningselement): En sekvens belägen uppströms om Tata -rutan, erkänd av transkriptionsfaktor IIb (TFIIB).
* uppströms regleringselement: Dessa element kan vara belägna hundratals eller till och med tusentals baspar uppströms om kärnpromotorn och påverkar transkriptionshastigheten. Exempel inkluderar:
* CAAT -låda: En konsensussekvens som binder transkriptionsfaktorer.
* GC Box: En GC-rik sekvens som känns igen av transkriptionsfaktorer.
* Enhancers: DNA -sekvenser som kan stimulera transkription, ofta belägna långt från kärnpromotorn.
* RNA -polymeras III (pol III): Transkriberar överföring av RNA (tRNA), 5S ribosomalt RNA (5S rRNA) och några små kärn -RNA (SNRNA) gener.
* Promotorstruktur:
* intern promotor: Beläget inom det transkriberade regionen för tRNA och 5S rRNA -gener.
* uppströms promotor: Ligger uppströms om det transkriberade regionen för vissa SnRNA -gener.
| RNA -polymeras | Transkript | Promotorer |
| --- | --- | --- |
| Prokaryota RNAP | mRNA, tRNA, rRNA | -10 Element, -35 Element, Upstream Elements |
| Eukaryota pol i | rrna | Kärnpromotör, UCE |
| Eukaryota Pol II | mRNA, några snrna | Kärnpromotör (Tata Box, INR, DPE, BRE), uppströms regleringselement |
| Eukaryota Pol III | tRNA, 5S rRNA, några snrna | Intern promotor (för tRNA, 5S rRNA), uppströms promotor (för vissa snRNA) |
Denna tabell är inte uttömmande, eftersom olika typer av promotorer och deras reglerande element finns inom varje grupp. De specifika sekvenserna och strukturerna för promotorer kan variera, vilket påverkar effektiviteten och regleringen av transkription.
