Det är emellertid viktigt att notera att klassificeringen av organismer i riken är ett något föråldrat system. Moderna klassificeringssystem, liksom tresidensystemet, har ersatt det traditionella femkungersystemet. I systemet med tre domäner är prokaryoter uppdelade i två domäner: bakterier och archaea .
Så medan "Monera" fortfarande används ibland för att hänvisa till prokaryoter, är det mer exakt att säga att prokaryoter tillhör domänerna bakterier och archaea.
