Neutrofila och acidofila heterotrofa bakterier utgör majoriteten av bakterier. Termerna "neutrofila" och "acidofila" refererar till bakteriearternas optimala pH-nivå, vilket är ett mått på substansens surhet eller basicitet. Till exempel mäter ättika som surt och natron som en bas. PH-skalan varierar mellan 0 och 14, med 7, rent vatten, mitt i mitten.

Neutrofila Heterotrophs

De flesta bakterier, neutrofiler, lever i mark eller vatten och växa bäst vid ett neutralt pH mellan 6 och 8. Om pH varierar för långt utanför detta intervall kan neutrofila bakterier inte överleva. De flesta bakterier som orsakar sjukdomar hos människor är också neutrofila heterotrofer, lämpade att överleva i en mänsklig kropp.

Acidofila Heterotrophs

Acidofila bakterier växer bättre vid lägre pH-nivåer, vanligtvis under ett pH-värde av 6, eftersom de har biologiska mekanismer som gör det möjligt för dem att hålla sitt inre pH nära neutralt. Acid minedränering - den förorenade, mycket sura avrinningen från gruvområdena - innehåller en hög population av acidofiler som oxiderar sulfiden som finns i metallmalmer. Enligt Science Education Resource Center vid Carleton College uppvisade acidophile Ferroplasma i syrgruvavloppet pH-nivåer så låga som noll.

Obligatoriskt Acidophil Heterotrophs

Obligatoriska acidofiler kräver ett lågt pH, under 4 eller 5, för att överleva. Cellmembranet av obligatoriska acidofiler löses faktiskt vid neutrala pH-nivåer, vilket orsakar celldöd. Många obligatoriska acidofiler är också termofiler - organismer som växer bäst vid höga temperaturer - och vanligtvis finns i vulkaniska jordar. Thiobacillus ferrooxidaner står förmodligen som den mest studerade järnoxiderande acidofila bakterien.