Liksom allt vatten har våtmarksvatten en pH-mätning. PH är vattnets surhet och våtmarker kan ha olika nivåer av surhet som växterna och djuren som bor i dem måste trivas. När pH förändras kan det döda dessa växter och djur samt förhindra att våtmarkerna fungerar. Det finns tre huvudfaktorer som kan påverka vattnets pH i våtmarker.
Avloppsvatten
Avloppsvatten är den viktigaste faktorn som kan ändra pH-värdet på alla våtmarker. Avloppsvatten är något vatten som förändras genom mänsklig bosättning och kan innehålla poolvatten, avloppsvatten och stormvattnet. Avloppsvatten kan behandlas med kemikalier för att rengöra eventuella farliga ämnen som för kommunalt avloppsvatten, eller det kan obehandlas som vid avloppsavloppet. Avlägsnandet eller tillsatsen av kemikalier till detta vatten, såväl som det befintliga pH-värdet i själva vattnet, kan väsentligt ändra pH-värdet på ett våtmark. Till exempel behandlas vatten i stora städer ofta för att vara "mjuka" eller sura än på landsbygden. Detta vatten har ett mycket lågt pH- eller en hög syrahalt, vilket ökar pH-värdet på ett våtmark. Om våtmarken har växter som inte tolererar surt vatten kan de dö av.
Mineraler
Mineraler som finns i jorden som omger våtmarkerna, som salt, kan påverka våtmarkens pH . Medan de flesta våtmarker acklimatiseras till mineralerna i den omgivande jorden kan mänsklig utveckling, gruv-, bygg- och industriverksamhet sätta olika mineraler i jorden som inte existerar där naturligt. Regnfallet kommer att filtrera genom dessa mineraler, lösa dem och transportera dem till våtmarkerna. Beroende på mineral kan våtmarkens pH stiga eller falla. Ett mineral som diabasstjärna, som är vanligt i stenbrott och gruvor, kan öka ett våtmarks pH om det bryts upp i närheten.
Acid Rain
Till skillnad från avloppsvatten och upplösta mineraler som kan orsaka att våtmarkens pH-värde varierar på något sätt, surt regn kommer bara att sänka pH-värdet, eller göra vattnet i våtmarken surt. Surt regn orsakas av föreningar i atmosfären som reagerar med varandra för att bilda syror som sedan faller tillbaka till jorden som regn. Några av dessa föreningar inkluderar svavel och kväve.