Forskare i Japan har skapat en databas med metaboliter från blodprov som samlats in från över 5, 000 japanska volontärer, gör det fritt tillgängligt online som en värdefull resurs för forskare runt om i världen.

Metaboliter och proteiner styr många av processerna i våra kroppar, och även informera om interaktionen mellan våra celler och deras omgivning. Förstå dessa föreningar och hur de relaterar till varandra mer, skulle kunna hjälpa forskare att utvärdera människors hälsotillstånd och utveckla nya personliga behandlingar för olika sjukdomar.

Databasen, vilken bioinformatikforskare Shu Tadaka från Tohoku University och hans kollegor kallade jMorp, innehåller information om 306 metaboliter och 256 vanliga proteiner som finns hos människor. Detta inkluderar deras frekvens, koncentration, och hur ofta de förekom hos män eller kvinnor och vid vilken ålder. Databasen är unik i det, istället för att bara visa rådata, det ger besökarna en chans att se hur de olika metaboliterna korrelerar med varandra grafiskt, bana väg för ytterligare studier för att identifiera hur dessa metaboliter och proteiner relaterar till varandra.

"Informationen i jMorp erhålls från statistisk data skapad genom att aggregera individuella data, "säger Tadaka." En oberoende kommitté har noga övervägt alla etiska frågor innan vi fick tillgång till dessa uppgifter. "

Liknande databaser täcker andra länder eller regioner, såsom Storbritannien och Irland, men vissa har begränsningar på grund av inkonsekvent datainsamling eller liten urvalsstorlek. Det stora antalet friska individer som bidrog med prover till jMorp gör det särskilt användbart. Forskarna samlade och analyserade också data med samma metod och vid samma institut, vilket minimerar mätfel. Dessutom, de vidtagit extra åtgärder för att utesluta alla prover av låg kvalitet och för att säkerställa kvalitetskontroll under hela insamlingsprocessen, lagra och analysera plasmaproverna. Dessa gör jMorp särskilt tillförlitlig som en resurs för forskare, särskilt biokemister och medicinska forskare.

För att göra det relevant och användbart för andra forskare, det japanska teamet har ställt in jMorp i ett användarvänligt format som gör att besökare enkelt kan nå den data de behöver, samt dra upp jämförelser och relationer mellan olika föreningar som visas visuellt. Användare kan söka efter den typ av förening de letar efter antingen med namn eller specifikationer. Sammanfattningen av data kan laddas ner och korrelationsgrafer kan sparas som bildfiler.

Databasen är ett pågående arbete och forskarna producerar uppdaterade årliga versioner allt eftersom de samlar in och analyserar fler prover. De planerar också att erbjuda mer insikt om metaboliter och proteiner de dokumenterar genom att tillämpa nya analysmetoder.