DNA igenkände autonomt två mikroRNA, miR-20a och miR-17-5p, och bildade en fyrvägsövergångsstruktur som fångades i nanopore, visar långa blockeringsströmmar. Kredit:Figur anpassad med tillstånd från Anal. Chem ., 2018, 90 (14), sid 8531-8537. © 2018 American Chemical Society
Småcellig lungcancer (SCLC) är mycket aggressiv, eftersom cancercellerna snabbt växer och sprids lätt i hela kroppen. Ofta, SCLC kan diagnostiseras med flera vanliga tester, men har dålig överlevnad efter metastasering.
Nu, forskare vid Tokyo University of Agriculture and Technology (TUAT) i Japan har utvecklat en enkel teknik för att identifiera SCLC tidigare. Detta jobb, publicerades i julinumret av Analytisk kemi , rapporter om nanoporeteknologi i kombination med DNA-beräkningsteknik för att fånga de tidiga biomarkörerna för SCLC, som var två oberoende mikroRNA.
"DNA-beräkningsteknik tillåter DNA-molekyler att autonomt känna igen mönstret av mikroRNA-molekyler och att förmedla informationen i form av elektrisk ström som genereras, " sa senior författare Dr Ryuji Kawano, docent, Institutionen för bioteknik och livsvetenskap, TUAT.
Dessa mikroRNA (miR-20a och miR-17-5p) är kända för att vara biomarkörerna för SCLC och utsöndras i patienter. "Vi designade diagnostiska DNA:n på konstgjord väg och utvecklade en nanopore-enhet som oberoende kände igen dessa mikroRNA genom mikrodroppar, " sa Dr. Kawano. De diagnostiska DNA:n kände igen de två mikroRNA:n och bildade den komplexa strukturen av mikroRNA och diagnostiskt DNA autonomt (se bild). I fallet med både miR-20a och miR-17-5p finns samtidigt, eller så finns det bara en, eller när ingendera existerar, (1 1), (1 0) eller (0 1), eller (0 0), respektive, alla olika fall särskiljdes av varaktigheten av de blockerande strömsignalerna utan märkning. Denna mätning kan utföras i cirka 1 timme.
Jämfört med cellbiopsi, flytande biopsi har nyligen blivit mer attraherad på grund av minimalt invasiv metod för tidig upptäckt av cancer. Detta resultat ger möjlighet till nästa generations diagnos för cancerspecifik diagnos från kroppsvätskor. Forskarna tillämpar denna teknik på riktiga kroppsvätskor.