Kemisk struktur hos ATMND-C 2 -NH 2 och sekvensen av den bakteriella (Escherichia coli) A-ställe-innehållande RNA-modellen som användes i denna studie. Den visar också den möjliga strukturen av komplexet mellan ATMND-C 2 -NH 2 (grön färg) och inre slinga av A-plats. Kredit:Seiichi Nishizawa
En forskargrupp vid Tohoku University har gjort en betydande upptäckt med positiva konsekvenser för utvecklingen av läkemedel som bekämpar bakterier. Aminoacyl-tRNA-stället (A-stället) i den 16S RNA-avkodande regionen i den bakteriella ribosomen ser lovande ut för en ny era av utveckling av antibiotikaläkemedel.
Traditionella aminoglykosidantibiotika är problematiska med tanke på deras höga toxicitet och potential för resistensutveckling. Forskningen vid Tohoku University fokuserade på bakteriell A-plats som binder små ligander vars strukturer skiljer sig från aminoglykosidfamiljen, som erbjuder potential för utveckling av nya läkemedel som behandlar bakteriella infektioner med en minskning av de problem som är förknippade med traditionella antibiotika.
Forskargruppen ledd av Dr Seiichi Nishizawa och Dr Yusuke Sato (Kemiska institutionen, Graduate School of Science) har rapporterat en ny liten ligand, ATMND-C 2 -NH 2 som har den hårdaste bindningsaffiniteten för det bakteriella A-stället bland icke-aminoglykosidliganderna.
ATMND-C 2 -NH 2 visar ett signifikant fluorescerande släckningssvar vid selektiv bindning till den inre slingan av det bakteriella (Escherichia coli) A-ställe-innehållande modell-RNA:t.
ATMND-C 2 -NH 2 har också visat sig vara användbar som en indikator för att bedöma interaktioner mellan ligand/A-ställe.
Resultaten som forskargruppen har erhållit erbjuder en rationell grund för generering av nya A-ställebindande ligander med sikte på nya antibiotika med mindre toxicitet och minimal resistensutveckling.
