I en första för växtvirologi, ett team från CIRAD använde nyligen nanopore-teknologi för att sekvensera hela genomen från två yam-RNA-virus. Denna lite använda men lovande molekylärbiologiska teknik banar väg för nya verktyg för fältdiagnos av växter, djur- och människors sjukdomar.

En ny, hög genomströmning, bärbar sekvenseringsteknik har utvecklats under de senaste åren för människors och djurs hälsa. Den använder mobila laboratorier för att diagnostisera virus som ebola eller zika nästan omedelbart, på fältet. Diagnosen är snabb och tidig, vilket undviker behovet av att överföra kontaminerade prover.

"Tekniken kännetecknas av produktionen av långa nukleotidsekvenser, som gör det möjligt att sekvensera hela virusgenomet, "Philippe Roumagnac, en virolog med CIRAD, förklarar. CIRAD var ett av de första laboratorierna i världen som testade och validerade dess användning inom växtvirologi. "Med hjälp av en sjuk yamväxt, det tog oss bara några timmar att sekvensera hela genomet av två enkelsträngade RNA-virus, ett makluravirus och ett potyvirus, ", tillägger hans kollega Denis Filloux.

Som med human virologi, det faktum att tekniken nu har validerats i ett växtvirologiskt laboratorium banar väg för realtid, mobil upptäckt av kroniska, säsongsbetonade eller nya växtvirus, även i isolerade områden. Genom att förkorta tiden som går mellan provtagning och diagnos, Tekniken kommer att hjälpa epidemiövervakningsnätverk att upptäcka skadliga organismer i ett tidigare skede.