Hudirritation
Citronsyra kan vara en mindre hudirriterande, vilket orsakar kliande hud och även små brännskador till de som är känslig för det. Händerna ska tvättas omedelbart om citronsyra kommer i kontakt med bar hud. Skyddshandskar bör bäras under hantering för att undvika oavsiktlig kontakt. Syran kan också irritera halsens väggar om de tas in eller bränna magen i magen om de tas i stora mängder.
Ögonirritation
Citronsyra är ett allvarligt ögonirriterande. Oavsiktlig kontakt med ögonen kan uppstå om frukten pressas och saften sprutar ut eller genom att röra ögonen när syran har kontaktat fingertopparna, vilket kan hända när du förbereder citroner, apelsiner eller andra citrusfrukter. Skyddsglasögon ska bäras vid arbete med citronsyra under laboratorieförhållanden. Ögon ska sköljas omedelbart med vatten om de råkar komma i kontakt med syran.
Tandkorrosion
Konsumtion av citronsyra kan leda till gradvis korrosion av tandemaljen. Detta kan vara ett problem med drycker som innehåller syran, som lemonad, apelsinjuice och många kolsyrade läskedrycker. Korrosion kan begränsas genom att man använder strån för att dricka sådana vätskor, eftersom syran kommer att omgå tänderna.
Falsk cancerframkallande
Villejuif-bipacksedeln var ett falskt vetenskapligt dokument som passerade runt 1980-talet, vilket innehöll citronsyra syra på listan över 10 potentiella cancerframkallande ämnen. Citronsyra har dock ingen vetenskaplig koppling till cancer och är ett helt säkert livsmedelstillsats. Felet i rapporten var påstått på grund av språklig förvirring, eftersom citronsyra är en del av en biologisk cykel som kallas Krebs-cykeln, och "Krebs" översättar löst till "cancer" på tyska.