Forskare från University of California, Irvine har utvecklat ett COVID-19-test som upptäcker och identifierar specifika SARS-CoV-2-varianter med 100 % noggrannhet. I en studie bestämde den RNA-kodade virala nukleinsyraanalytiska reportern korrekt de genetiska alfa-, gamma-, delta-, epsilon- och omicron-mutationerna i nasofaryngeala kliniska prov. Denna förmåga skulle kunna göra det möjligt för vårdgivare att fatta personliga behandlingsbeslut för förbättrad patientvård.

Nyligen publicerad online i Journal of the American Chemical Society , en artikel om forskningen beskriver designen och valideringen av Revealr SARS-CoV-2 genotypningssystem.

"Covid-19-pandemin har skapat ett akut behov av individualiserade diagnostiska verktyg som kan känna igen förekomsten av viruset såväl som den speciella stammen. Identifiering och triaging av patienter infekterade med varianter som ökar virusöverföringen och minskar vaccinskyddet är avgörande för att kontrollera spridningen av sjukdomen", säger motsvarande författare John Chaput, UCI-professor i farmaceutiska vetenskaper. "Revealr går längre än enkla covid-detekteringsmetoder, såsom det vanliga antigenkitet, för att identifiera den exakta SARS-CoV-2-stam som infekterar en patient."

Teamet analyserade 34 kliniska prover som samlats in i början, mitten och slutet av 2021 på UCI Medical Center från patienter som upplever covid-19-symtom. RNA:t isolerades från nasofarynxproverna och den korrekta SARS-CoV-2-varianten identifierades i varje fall.

"Även om Revealr utvecklades som en COVID-detektionsanalys, är nästa steg att expandera till andra luftvägsinfektioner som delar symptom med COVID-19, som influensa," sa Chaput. "Förmågan att särskilja enpunktsmutationer i en genetisk DNA- eller RNA-sekvens gör den idealisk för alla genotypning, inklusive cancer. Utöver människors hälsa kan Revealr hitta användning i rättsmedicinska eller jordbruksapplikationer som för närvarande är beroende av DNA-sekvensering."

I studiegruppen ingick Chaput-labbetsmedlem Kefan Yang, en doktorand i kemi och biomolekylär ingenjörskonst; Chaput labbmedlem Daniel Schuder, doktorand i molekylärbiologi och biokemi; och Arlene Ngor, som leder Chaput-labbet.

Forskarna har lämnat in en patentansökan på Revealr genotypning. + Utforska vidare

Forskare utvecklar snabbt covid-19-test för att identifiera varianter i timmar