Effektiviteten hos CTL beror på olika faktorer, inklusive typen och kvaliteten på det kol som används, den använda tekniken och den övergripande processdesignen. I allmänhet har CTL-anläggningar lägre total effektivitet jämfört med konventionell råoljeraffinering, eftersom processen kräver ytterligare steg och energiinsatser för att omvandla det fasta kolet till ett flytande bränsle.
Enligt uppskattningar från U.S. Department of Energy kan den totala energieffektiviteten för CTL-anläggningar variera från cirka 45 % till 65 %. Det betyder att för varje energienhet som tillförs i form av kol kan cirka 45 % till 65 % omvandlas till flytande bränsleprodukter. Det är dock viktigt att notera att dessa effektivitetssiffror är mycket anläggningsspecifika och kan variera avsevärt beroende på den specifika teknik som används och driftsförhållandena.
Som jämförelse är bensin, ett petroleumbaserat bränsle, relativt mer effektivt att producera från råolja. Moderna raffinaderier kan uppnå energieffektivitet på cirka 85 % till 90 % vid omvandling av råolja till bensin, eftersom raffineringsprocesserna är optimerade för effektiv kolväteomvandling.
När man överväger effektiviteten hos CTL kontra bensin är det också viktigt att överväga miljökonsekvenserna. CTL-processer kan vara mer kolintensiva än bensinproduktion, eftersom de involverar ytterligare energiinsatser och utsläpp av växthusgaser. Därför bör den övergripande miljöpåverkan av CTL noggrant övervägas när man utvärderar dess effektivitet jämfört med bensin.