Några av de potentiella föroreningarna som finns i Indian River Lagoon inkluderar:
* Näringsämnen: Överskott av näringsämnen från gödningsmedel och avrinning av avloppsvatten kan leda till algblomning och andra problem med vattenkvaliteten. Algblomningar kan producera gifter som kan vara skadliga för människor och vilda djur.
* Bakterier: Bakterier från mänskligt och animaliskt avfall kan förorena lagunen och orsaka mag-tarmsjukdomar hos människor som kommer i kontakt med vattnet.
* Bekämpningsmedel: Bekämpningsmedel som används inom jordbruk och gräsmatta kan också förorena lagunen och utgöra en hälsorisk för människor och vilda djur.
* Tungmetaller: Tungmetaller som bly och kvicksilver kan ansamlas i vävnader hos fiskar och andra vattenlevande organismer och kan utgöra en hälsorisk för människor som konsumerar dessa organismer.
FDEP rekommenderar att människor alltid bör följa de senaste hälsoråden när de simmar, fiskar eller deltar i andra aktiviteter i Indian River Lagoon. Avdelningen uppmuntrar också människor att vidta åtgärder för att minska sin miljöpåverkan, som att använda gödningsmedel och bekämpningsmedel sparsamt och att kassera mänskligt och animaliskt avfall på rätt sätt.