1. Utfällning av nukleinsyror: Natriumacetat, när det tillsätts till en DNA-lösning under kontrollerade temperatur- och pH-förhållanden, hjälper till vid utfällningen av nukleinsyror (både DNA och RNA) från lösningen. Det minskar lösligheten av DNA genom att neutralisera de negativa laddningarna som finns på fosfatryggraden i DNA-molekylen. Detta gör att DNA:t kan bilda olösliga salter, som lätt kan separeras från de andra komponenterna i cellysatet.
2. Borttagning av föroreningar: Natriumacetat hjälper till att avlägsna föroreningar, såsom proteiner, cellrester och andra föroreningar, under DNA-isolering. När natriumacetat tillsätts förblir dessa föroreningar i lösning, medan det utfällda DNA:t kan samlas upp genom centrifugering.
3. pH-kontroll: Natriumacetat fungerar som en buffert för att upprätthålla lämpligt pH under DNA-isolering. Det optimala pH-värdet för DNA-utfällning är vanligtvis mellan 5,0 och 5,2. Natriumacetat hjälper till att upprätthålla detta pH-område, vilket är avgörande för effektiv DNA-utfällning.
4. Hög saltkoncentration: Den höga saltkoncentrationen som skapas av natriumacetat i lösningen underlättar bildandet av DNA-proteinkomplex. Dessa komplex är väsentliga för effektiv separation av DNA från andra cellkomponenter.
5. Optimering av DNA-återvinning: Natriumacetat bidrar till att optimera utbytet av DNA-återvinning genom att minska ospecifika interaktioner mellan DNA och föroreningar. Korrekt saltkoncentration hjälper till att säkerställa att DNA:t fälls ut selektivt, vilket minimerar förlusten av DNA under isoleringsprocessen.
6. Kompatibilitet med efterföljande steg: Natriumacetat är kompatibelt med efterföljande steg i DNA-isolering och rening. Det utfällda DNA:t kan lätt tvättas, återupplösas i lämpliga buffertar och vidarebearbetas för nedströmsapplikationer såsom PCR, enzymatiska reaktioner eller sekvensering.
Sammantaget spelar natriumacetat en viktig roll i utfällningen av DNA från cellysat under DNA-isolering. Det bidrar till effektiv separation av DNA från föroreningar, bibehåller optimala pH-förhållanden och underlättar nedströms bearbetningen av det isolerade DNA:t.
