Fotogen kommer vanligtvis i en transparent eller ljusgul färg. Det kan dock ibland verka vara olika färger på grund av föroreningar eller tillsatser. Till exempel kan fotogen som har färgats rött användas som uppvärmningsbränsle för att skilja det från andra typer av fotogen. Dessutom kan fotogen som har förorenats med vatten eller andra ämnen tyckas ha en annan färg.