Aminosyror innehåller också en aminogrupp (-NH2), som är en grundgrupp. Amino -gruppen kan acceptera en vätejon (H+), vilket ger aminosyran en nettopositiv laddning. Denna positiva laddning är det som ger aminosyror deras grundläggande egenskaper.
Balansen mellan de sura och grundläggande grupperna i aminosyror avgör deras totala laddning. Vid neutralt pH har de flesta aminosyror en negativ laddning av nätet eftersom karboxylgruppen är surare än aminogruppen. Vissa aminosyror, såsom lysin och arginin, har emellertid fler grundgrupper än sura grupper och har därför en nettopositiv laddning vid neutralt pH.
