Bakterierna som omvandlar ammoniakjoner (NH₄⁺) till nitratjoner (NO₃⁻) kallas nitrifierande bakterier . Denna process kallas nitrifikation och förekommer i två steg:

1. nitrifikation - ammoniakoxiderande bakterier (AOB) , såsom *nitrosomonas *, konvertera ammoniak till nitrit (no₂⁻).

2. nitritoxidation - nitritoxiderande bakterier (NOB) , såsom *nitrobacter *, konvertera nitrit till nitrat.

Så samtidigt är de nitrifierande bakterierna som är ansvariga för att konvertera ammoniakjoner till nitratjoner:

* ammoniakoxiderande bakterier (AOB): *Nitrosomonas*,*nitrosospira*, etc.

* nitritoxiderande bakterier (NOB): *Nitrobacter*,*nitrospira*, etc.