1. Linjär: Atomer är sammankopplade i en rak linje, som i molekylen metan (CH4 ).
2. Förgrenat: Atomer är sammankopplade på ett icke-linjärt sätt, med grenar som sträcker sig från huvudkedjan, som i molekylen isobutan (C4 H10 ).
3. Cyklisk: Atomer är sammankopplade i en sluten slinga och bildar en ringstruktur. Detta kan vara enkelt, som i cyklohexan (C6 H12 ), eller komplex med flera ringar smälta samman.
Dessa tre grundläggande strukturer är grunden för den enorma mångfalden av organiska molekyler, som utgör grunden för allt levande.