Kol finns i vatten och sediment från sjöar, floder, bäckar, flodmynningar, djuphavet, grundvatten och akviferer, inlandsisar och våtmarker. Kol i dessa vattensystem kan klassificeras som antingen löst organiskt material, partikelformigt organiskt material och oorganiskt material eller levande organismer som bakterier, kiselalger, dinoflagellater, fiskar, svampar, vattenväxter, djurplankton, alger, kräftor, musslor, maneter, sjölejon, valross, hajar, valar, sköldpaddor, etc.