1. Omkristallisering: Mineralerna i den ursprungliga berget (protoliten) omorganiseras och omkristalliseras ofta till nya mineraler. Denna process kan förstöra alla befintliga fossila strukturer.
2. Deformation och skjuvning: Det enorma trycket kan leda till att stenar deformeras och viks. Detta kan krossa, förvränga eller utplåna alla fossiler närvarande.
3. Kemiska reaktioner: De höga temperaturerna kan driva kemiska reaktioner som förändrar bergetens sammansättning, upplösning eller förändrar det ursprungliga fossila materialet.
4. Upplösning: Vissa fossiler, särskilt de som är gjorda av kalciumkarbonat (som skal), kan lösas av vätskorna som cirkulerar genom den metamorfiska berget.
5. Mineraltillväxt: Nya mineraler kan växa inom berget, ytterligare dölja eller förstöra eventuella fossila rester.
6. Foliation: Många metamorfiska bergarter utvecklar en skiktad struktur (foliering) på grund av trycket. Detta kan snedvrida eller bryta isär fossiler.
Obs: Även om de intensiva förhållandena för metamorfism i allmänhet gör det svårt att bevara fossil, är det inte omöjligt. Vissa fossiler kan överleva om de är:
* gjord av resistent material: Fossiler gjorda av kiseldioxid (som vissa radiolyser) eller resistenta mineraler som kvarts är mer benägna att överleva.
* skyddad av omgivande sten: Om fossilen är innesluten i ett mycket hårt eller resistent bergskikt, kan det vara skyddat från de mest intensiva metamorfiska processerna.
* Metamorfosed vid lägre betyg: Vid lägre temperaturer och tryck kan vissa fossil överleva, särskilt om de redan är inneslutna i hållbar sten.
Sammantaget är bildandet av metamorfiska bergarter en mycket destruktiv process för fossiler. Möjligheten att hitta fossiliserade rester inom metamorfiska bergarter finns emellertid, även om det är mycket mindre vanligt än i sedimentära bergarter.