Ja, Niagarafallen är ett hinder för fiskrörelser. Fallen skapar ett betydande vertikalt fall, vilket gör det omöjligt för fiskar att simma uppströms. Detta har resulterat i separation av fiskpopulationer ovanför och under fallen. Som ett resultat har distinkta fisksamhällen utvecklats på vardera sidan av fallen, med vissa arter som bara finns ovanför och andra bara under fallen. Till exempel finns sjöstör, muskellunge och gös endast i den övre Niagarafloden, medan arter som snäckor, nordlig gädda och kanalmal endast finns i den nedre floden.