Samarbetspartners från Mayo-Illinois Alliance for Technology Based Healthcare har utvecklat en ny, enkelmolekyltest för att detektera metylerat DNA. Metylering - tillägget av en metylgrupp av molekyler till en DNA-sträng - är ett av sätten som genuttryck regleras. Fynden visas i det aktuella numret av Vetenskapliga rapporter .

"Medan nanoporer har studerats för genomisk sekvensering och screeninganalys, denna nya analys kan potentiellt kringgå behovet av några av de nuvarande processerna för att utvärdera epigenetikrelaterade sjukdomar, " säger George Vasmatzis, Ph.D., medledare för Mayos Biomarker Discovery Program i Center for Individualized Medicine och medförfattare till artikeln. Han säger att analysen kan eliminera behovet av bisulfitomvandling av DNA, fluorescerande märkning, och polymeraskedjereaktion (PCR).

"Nästa steg inkluderar att öka den rumsliga upplösningen genom att införliva tunnare membran och genom att integrera samma förberedelsesteg, " säger Rashid Bashir, Ph.D., professor i bioteknik, chef för mikro- och nanotekniklaboratoriet, och medförfattare till studien vid University of Illinois i Urbana-Champaign.

En nanopor, I detta fall, är ett mycket litet hål i ett konstgjort membran, som gör att endast en enda molekyl kan lokaliseras och identifieras. Forskare säger att detta är användbart eftersom metylering i promotorsekvenser kan indikera tumörutveckling i de flesta huvudtyper av cancer och kan vara en bättre biomarkör än många genetiska markörer. Forskare kan nu skilja metylerat från icke-metylerat DNA genom att fästa ett protein på de metylerade nukleotiderna som mäter jonisk elektrisk ström via en nanopor i fast tillstånd.