Olika mikroorganismer kräver ofta olika miljöer, med varierad temperatur, syrsyra, ljus och surhet eller pH-nivå. Vissa mikrober växer snabbare i miljöer med extremt låga pH-värden. Dessa kallas acidophiles, på grund av deras preferens för sura miljöer. Även om de flesta mikroorganismer kräver neutrala pH-värden för optimal tillväxt, föredrar alkalifila mikroorganismer lågsyra eller hög pH-miljö.
Acidofiler
Mikroorganismer som optimerar tillväxt vid pH-nivåer lägre än 5 kallas acidofiler. Dessa mikrober finns i en mängd olika miljöer, inklusive geysrar och svavelpulver, såväl som i magen. Exempel på acidofiler inkluderar mikroskopiska algerna Cyanidium caldarium och Dunaliella acidophila. De mikroskopiska svamparna Acontiumcylatium, Cephalosporium och Trichosporon cerebriae kan växa nära pH 0. En primitiv mikroorganism, kallad Picrophilaceae, har optimala pH-värden nära noll och kan också växa till negativa pH-värden.
Alkalifilt
Alkalifila mikroorganismer har optimal tillväxt vid pH-värden mellan 9 och 12. Dessa mikroorganismer trivs i alkaliska sjöar, jordar och andra höga pH-miljöer. I slaggdump av Lake Calumet, sydöstra Chicago, kan vattnet nå ett pH på 12,8, vilket liknar kaustisk soda. Vissa bakterier relaterade till Clostridium och Bacillus lever i den extremt alkaliska miljön. Mono Lake, Kalifornien och Octopus Spring i Yellowstone Park är exempel på miljöer där alkalifila mikroorganismer hittas.
Neutrofiler
Neutrala pH-värden, som ligger mellan 6 och 8, finns vanligare i natur. De flesta mikroorganismer har anpassat sig till att ha optimala tillväxter i surhetsneutrala miljöer längs deras utveckling. Dessa mikroorganismer kallas neutrofiler, och inkluderar de flesta arter av mikroalger och andra organismer som bildar fytoplankton, liksom vissa jordbebyggande bakterier och jäst.
Patogener och PH
De flesta mikroorganismer som är associerade med Människa, djur och växtsjukdomar är neutrofiler, såsom Escherichia coli, vilket orsakar intestinala infektioner. Erwinia caratovora, en växtparasit; Pseudomonas aeruginosa, vilket orsakar en serie infektion hos människor och djur. och Streptococcus pneumoniae, vilket orsakar lunginflammation. Patogener finns emellertid även bland acidofiler och alkalifilika. Bakterien Lactobacillus acidophilus har optimal tillväxt i låga pH-nivåer vilket orsakar vaginala infektioner. Den alkalifila bakterien Vibrio cholerae orsakar kolera hos människor.
