DNA-strukturen visades vara en dubbel-helix år sedan, men konventionen att namnge varje sträng har blivit ett förvirringsämne för både forskare och studenter. En kallas Watson och den andra Crick, efter de två medforskarna av DNA. Men den vetenskapliga litteraturen håller inte med om vilken sträng som ska anges vilket namn. Watson-Crick namngivningssystemet var tänkt att ange de olika funktionella egenskaperna hos varje sträng, vilket är samma mål för de andra namngivningssystemen. Det är viktigt att förstå de olika sammanhang där de enskilda strängarna behöver ta på sig olika namn. Två perfekta exempel är deras olika roller i DNA-replikation eller transkription. Att veta vad varje sträng gör i en biologisk process hjälper till att klargöra varför det gavs det namnet.
Anti-Sense är inte nonsens
Transkription är processen att kopiera DNA till RNA. Det görs av ett enzym som heter RNA Polymerase (RNA Pol). RNA Pol läser endast en av de två DNA-strängarna, eftersom den gör RNA-molekylen. Den dubbelsträngade DNA-molekylen är uppdelad och RNA Pol binder till en sträng, vilken den kommer att läsa och kopiera. Denna sträng kallas mallsträngen eller antisenssträngen. RNA-molekylen som produceras kommer att komplettera mallsträngen, vilket betyder att nukleotiderna i mallsträngen och RNA-molekylen matchar varandra enligt reglerna: adenin till uracil och guanin till cytosin.
Den här Gör Sense
När RNA transkriberas från DNA, binder RNA Polymeras till och kopierar mallsträngen. Den återstående strängen kallas kodningssträngen (se referens 5) eller känslighetssträngen. Med tanke på basparringsreglerna för nukleinsyror (A-par med T- och G-par med C) har kodningen eller sinnen DNA-strängen en identisk sekvens som den för RNA som produceras. Undantaget här är att RNA innehåller nukleotiden U (uracil) i stället för T (tymin), båda vilka par med A (adenin).
Smooth Ride
Innan mitos eller celldelning , cellen måste replikera sitt DNA så att varje dottercell kommer att ha ett identiskt antal DNA-strängar. DNA-polymeras är enzymet som kopierar långa sträckor av DNA till mer DNA. Vid replikationsgaffeln tränger DNA-molekylen ut för att bilda en bubbla i vilken Polymeras glider. Polymeras binds till båda strängarna i det avlindade DNA och börjar göra kopior av båda strängarna. En av kopiorna är gjorda som en enda kontinuerlig sträng, som kallas ledande sträng. DNA-replikering är ett annat fall där DNA-strängerna har olika namn.
Stopp och gå trafik
DNA-stegens anti-parallella struktur betyder att en sträng går från huvud till svans medan den andra strängen löper från svans till huvud. Under DNA-replikation måste DNA-polymeras läsa och kopiera båda strängarna samtidigt, även om de löper i motsatta riktningar. Eftersom DNA-polymeras endast kan läsa och kopiera DNA-strängar i en riktning - svans-mot-huvudet - den sträng som Polymeras möter som orienterad i huvudet, kan inte läsas och kopieras som en kontinuerlig sträng. Denna huvud-till-svanssträng kopieras som korta fragment, som kallas Okazaki-fragment, som senare smältas till en lång sträng. Vid DNA-replikation kallas strängen som bildas i fragment, den släpande strängen.