Gelelektrofores är en metod som används i laboratorier för att mäta och sortera DNA-strängar. Det är nödvändigt eftersom DNA under normala förhållanden är för liten för att manipulera, även när man tittar med de flesta mikroskop. Gelelektrofores är en relativt enkel procedur, och samma grundläggande teknik kan användas för att separera enskilda proteiner också.

Gelmatrisen

För att börja gelelektrofores måste du först skapa gelén . Vanligtvis tillverkas geler i tunna skivor med användning av en substans som kallas agaros. Pulveriserad agaros placeras i en flaska, följt av en saltvattenlösning som kallas buffert. Denna blandning av agaros och buffert upphettas tills de två substanserna smälter samman och hälls sedan i en formningsform. En anordning som kallas en kam placeras sedan i ena änden av formen innan gelén kyls. När gelén kyls avlägsnas kammen och lämnar små slitsar som kommer att användas för att hålla DNA-prover.

En särskild egenskap hos den kylda agarosblandningen (kallad en gelmatris) härrör från det faktum att det är skapad med saltvatten. När elektrifierad blir matrisen ledande, så att el kan strömma längs dess längd. En annan speciell egenskap hos gelmatrisen är förekomsten av vanliga mikroskopiska hål. Dessa hål tillåter DNA-strängar att passera genom gelmatrisen och underlätta sorteringsprocessen.

Electrophoresis Chamber

Nästa steg är att skapa en elektroforeskammare. Detta är en liten rektangulär låda som är kopplad med en positiv och negativ elektrisk anslutning i båda ändar. Kammare är vanligtvis grunda, små nog att passa på en bordplatta, och byggda av klara material som plexiglas.

Saltvattenlösning hälls i botten av elektrofores kammare och gelmatrisen är nedsänkt något i denna lösning . Saltvattnet har två syften: att hjälpa flödet av el och hålla gelmatrisen fuktig. Eftersom DNA drivs av en negativ laddning, placera din matris så att dina prover kommer att ligga bredvid din negativa elektriska anslutning.

Förbereda DNA

DNA-prov framställs sedan. Eftersom DNA i lösning är allt men omöjligt att se, läggs ett färgämne som heter en laddningsbuffert till varje enskilt prov. Denna agent förtorkar också DNA-lösningen, vilket gör den mindre rinnande och mer användbar. Använd en pipett, överför ett prov av DNA-lösning till varje växelvis slits i gelmatrisen. I den tomma spalten mellan varje prov placerar du någon lösning av DNA vars längd du redan vet (kallad DNA-standard) för experimentkontroll och jämförelse.

Slå på strömmen

Nu slår du på elektrofores kammare. Under negativ effekt kommer dina DNA-prov att tvingas över kammarens längd. Små DNA-strängar kommer att flytta snabbare genom gelmatrisen, och inom en kort tid kommer de att separera sig från längre, långsammare strängar. Färgen i färgämnet låter dig följa DNA-spåret. Du kommer inte att kunna se enskilda DNA-strängar, men strängar av samma längd kommer att klumpa ihop.

Slutliga steg

När DNA-talet utlöses, tas matrisen bort från elektroforesen kammare. Därefter färgas DNA för att möjliggöra enklare mätning och undersökning.