Ett internationellt samarbete som involverar Earlham Institute, Norwich, STORBRITANNIEN, och Iwate Biotechnology Research Centre, Japan, har för första gången tillhandahållit en genomsekvens för den vita Guinea yam, en basgröda med enorm ekonomisk och kulturell betydelse på den afrikanska kontinenten och en livlina för miljontals människor.

Yams är en basdel av den nigerianska dieten, med Nigeria som står för cirka 70% av världens yamproduktion, men med nuvarande konsumtionstakt börjar efterfrågan överträffa utbudet av denna ekonomiskt viktiga gröda med stor kulturell betydelse.

Att dechiffrera jamsgenomet är av avgörande betydelse eftersom, till skillnad från andra basgrödor som vete, majs och ris, grödan är relativt odämjt. Domesticerade grödor har fördelar jämfört med deras vilda släktingar när det gäller att odla dem, inklusive enklare användbarhet och högre avkastning. Att förstå genomik av denna avgörande växt kommer att hjälpa bönder att öka avkastningen och hållbarheten hos jams.

Den nya forskningen med titeln "Genomsekvensering av basfödogrödan vit Guinea yam möjliggör utvecklingen av en molekylär markör för könsbestämning, " finns öppet tillgängligt i tidskriften BMC Biologi , visar hur det kan göras möjligt. Den högkvalitativa utkastet till genomsekvensen är tillgänglig i de offentliga databaserna DDBJ och NCBI.

Det stora genombrottet från ett internationellt samarbete mellan institut i Storbritannien, Tyskland, Japan och Nigeria, har identifierat de delar av genomet som bestämmer kön i jams (dioecy), och kunskap om denna sällsynta egenskap är avgörande för att förbättra hastigheten i markörstödda avelsprojekt.

dioecy, växter med separata hanar och honor, är relativt sällsynt och förekommer endast i cirka 5-6% av blommande växter, inklusive jams och sparris. Därför, att förstå processen i jams kan hjälpa till att förbättra andra ekonomiskt viktiga grödor.

Viktigast för Central- och Västafrika, denna nya kunskap kommer att hjälpa till att omvandla yams från att vara en försummad "föräldralös" gröda. Med assisterade avelsprogram, grödan kan tämjas bättre, öka livsmedelsförsörjningen och ekonomiskt välbefinnande i ett område som genomgår världens snabbaste befolkningsexpansion.

Benjamin White, som ledde Earlham Institutes bidrag, sa, "Att ha en referenssekvens för den vita Guinea yam ger oss den unika möjligheten att få en bättre förståelse av dioecy, en mycket sällsynt egenskap hos blommande växter, i en art som är väldigt evolutionärt differentierad från det mesta som har sekvenserats hittills. Att förstå denna egenskap och ha en genomisk resurs för vit Guinea yam kommer att vara ovärderligt för att föda fram en bättre yam, en som kommer att förbättra livsmedelssäkerheten i Väst- och Centralafrika, och försörjningen för småbrukare där."

Dr Robert Asiedu, Direktör, Forskning för utveckling, för International Institute of Tropical Agriculture-West Africa, Ibadan, Nigeria, sa, "Detta är ett viktigt genombrott. Det betyder att yam har anslutit sig till dessa grödor med en fullständig DNA -sekvens, en utveckling som började med ris för några år sedan. Konsekvenserna är djupgående. Den fullständiga DNA-sekvensen kommer i hög grad att underlätta vår förståelse av den genetiska kontrollen av nyckelegenskaper som blomning, sjukdomar, och andra inklusive kvalitetsegenskaper, och detta kommer i sin tur att göra förädlingen av nya sorter både snabbare och mer exakt".

Professor Ryohei Terauchi, huvud författare, vid Kyoto University och Iwate Biotechnology Research Centre, Japan, sa, "Detta kommer att hjälpa till att övervinna några av de många utmaningar som yambönder står inför i Afrika och andra delar av världen. Dessa inkluderar skadedjur och sjukdomar, förluster efter skörd och behovet av att utveckla mer hållbara system för jordbruk för grödan".